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中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员团队的文章“Maternal and neonatal viromes indicate the risk of offspring"s gastrointestinal tract exposure to pathogenic viruses of vaginal origin during delivery”于2022年8月25日在mLife正式上线。该研究团队基于对99对母婴6个身体部位486个样本的宏基因组测序和病毒组分析，绘制了高分辨率的代际病毒组图谱，发现顺产分娩新生儿的口腔和肠道中检测到的多数病毒来源都可以追溯到母体阴道。
背景介绍生命早期的肠道微生物组和病毒组备受关注，它们在塑造人体初始免疫和代谢系统中发挥重要作用。近期研究发现1-2岁时肠道病毒和麸质饮食的累加效果加剧了儿童乳糜泻风险。然而，病毒可能已经在更早的时期从母体传播给新生儿。本研究试图找出新生儿在出生时从母体获得了哪些病毒，并评估是否有必要在分娩前检查孕妇的病毒组。
科学发现1. 新生儿出生即拥有高度多样化的病毒组新生儿体内先锋病毒种类异常繁茂，并且母子间及不同身体部位的相对丰度差异明显（图1）。与新生儿口腔、母体皮肤和阴道中的病毒相比，胎便中的病毒特别丰富，这表明病毒在出生时已在胃肠道内大量积累。2.新生儿病毒组因分娩方式而异剖腹产新生儿大约40%的病毒来源不明，而顺产分娩的新生儿从母体阴道获得了大量病毒；新生儿口腔中阴道病毒的比例特别高（56.9%），可能是在顺产分娩过程中直接经口接触并立即定殖的阴道病毒。3. 顺产新生儿携带更多阴道来源的噬菌体与剖腹产和顺产分娩新生儿的胎便相比，顺产分娩新生儿的口腔内发现了更多阴道噬菌体，证实了病毒在出生时沿阴道-口腔途径快速传播；传播事件主要发生在Siphoviridae和Myoviridae类群中，新生儿口腔和母体阴道的共有噬菌体以乳酸杆菌噬菌体居多。4. 顺产分娩增加了病毒传播的风险顺产分娩新生儿获得的阴道病毒数量明显大于剖腹产新生儿，这表明真核病毒或在顺产分娩期间从母体传播到子代，其中Mimiviridae、Orpheovirus和Megavirus的检出率最高，其他如疱疹病毒、牛痘病毒、肝炎病毒也有发现（图2）。总结展望该研究表明，新生儿在顺产分娩通过生殖道时会接触到阴道病毒，这可能对他们的生命健康构成潜在威胁。因此，顺产分娩的好处并非绝对，从病毒传播的角度来看是有先决条件的。这些发现给生殖和妇幼保健带来新的启示，即需要考虑更合理、规范的分娩程序，包括在分娩前筛查阴道病毒组，警惕致病性病毒跨代传播到子代消化道的风险。
